如何描述一个网络
Degree Distribution
P(k): 随机选择的节点, 度为k的的概率分布, 使用直方图来描述
其中 表示度为k的节点数, 比如上图中,度为1的节点数有6, 所有节点数为10, 所以
Path Length
Path: path是指每个节点连接下一个节点的序列,其中,一个path能够重复多次相同的边, 如下图: ACBDCDEG
Distance: 连接节点对最少数量的边,称为两个节点间的distance,如下图,其中 , 若图中两节点无连接,或中间连接断开,则distance为无穷,在有向图中,distance的计算应该考虑两个节点间的方向,如下图
,不是对称的:
Diameter 在graph中,所有节点对当中最长distance; Average path length 针对graph来说, average path length计算公式如下:
其中 是node i到node j的distance,
是指图最多可存在的边数:
Cluster coefficient
cluster coefficient 对于无向图,用来描述节点i与他的邻居的链接情况, 其中节点i的度为 ,clustering coefficient计算公式如下:
如下图, 图的node i的cluster coefficient计算如下:
Average clustering coefficient:
avg. clustering: C= (1+1/3+1/3+1)/8=1/3
Connected components
Connectivity 图当中最大的可连接的component:能够通过path链接的任意两个几点的最大的集合; 如何找到图当中的connect components,从图中随机节点开始,按广度优先策略遍历,标记遍历过的节点,如果,所有的节点均被遍历,那幺这个未connected component, 否则从未遍历的节点中随机开始,重复广度优先策略遍历;
描述实际中的图:MSN Messenger
msn一个月的相关的数据,如下:
Degree Distribution
x坐标log之后:
可见大部分的节点degress在个位数。
Clustering
将所有的节点的k与c绘制在如下图中,整个graph的avg culstering coefficient约为0.1140
Connected Components
Diameter
msn的graph中平均path length为6.6, 90% 的节点能够触及在8个链接后触及到另一节点;
图的核心属性如何使用?
这些graph的属性是意外的还是在我们本身预料之中?
PPI Network
Random Graph Model
Simplest Model of Graph
ER Random Graphs 两个变种:
1. : n个节点的无向图,其中每一条边是概率为p的独立同分布;
2. : n个节点的无向图,其中m个边均匀随机生成;
需要说明的是,n, p 无法唯一地的决定graph,如下图,相同的n,p下, 我们有不同的图:
Degree Distribution of 
假定 表示度为k在所有节点中的占比, 则
很明显的binomial distribution, 所以均值、方差为:
标准差率为: ,当图无限大的时候,则标准差为0, 所有的节点都为
。
Clustering Coefficient of 
已知 边为概率为p的独立同步分, 其中
, 故
Expansion
定义 : 如果一个graph的任意的子集S,子集中边的条数大于alpha乘以子集或者graph去除子集之后的节点数量, Expansion通常用来衡量图的鲁棒性:
这张ppt没理解清楚,
在 中,n*p为常数,所以avg deg k也为常数:
Connected Components
,Largest CC中节点占图中所有节点的比例
Random Graph Model vs. MSN
在Random Graph Model 和实际的MNS的4个核心属性对比:
真实网络和Random Graph类似吗 ?
Giant Connected component: yes
Average path length: yes
Clustering Coefficient: No
Degree Distribution: No
The Small-World Model–能同时保证high clustering且短path的图吗?
回顾下前面MSN network,clustering coef为0.11, 而 的clustering coef为
。 另外一个例子, IMDB数据集、Electrical power grid, Network of nerons中:
其中h:average shortest path length, C: avg clustering coefficient, random,是保证相同avg degree,相同节点下的图的情况。
下图左边:高clustering coefficient: 朋友的朋友是我的朋友;
Small-World同时保证high cluster and low diameter; 如下图,从high clustering/high diameter, 到low clustering/low diameter, 增加随机性(p变大): 即随机的将一条边的另一个端点连接到任意较远的节点上,这样可以保持high clustering,low diameter;
下图中的p区域保证保证high clustering 和low path length:
Kronecker Graph Model: Generating large realistic graphs
递归的graph的生成: Self-similarity
Kronecker Produce 是一种生成self-similar矩阵的方法:
Kronecker Product 定义如下:
举个例子:
构建一个 的初始概率矩阵;
计算k阶Kronecker 矩阵;
遍历k阶矩阵,按 构建edge(u, v)链接
如上图最后, 需要模拟 次,耗时太高, 是否有更高效方法(利用其递归结构)?
真实网络与Kronecker网络很相似, 右上角为其初始矩阵:
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