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领域应用 | OMAHA联盟发布“疾病临床表现”、“中毒”知识图谱及OMAHA知识库

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转载公众号 | OMAHA联盟

 

资源发布

 

OMAHA已建立“七巧板”医学术语集、“汇知”医学知识图谱、元数据等资源,将于每月发布其中一项。 具体各项发布时间为: “七巧板”术语集于每季度第一个月20日发布, “汇知”图谱于每季度第二个月20日发布,元数据于每季度第三个月20日发布。 敬请关注!

 

“汇知”医学知识图谱是OMAHA联盟发布的医学知识图谱资源的总称,主要切入疾病、手术操作、检验检查、药品的知识,在每个季度第二个月20号定期发布。截止2020年11月,“汇知”图谱已发布“药品适应证”、“临床路径”、“疾病科室”、“心血管专科疾病”和“新型冠状病毒肺炎”领域知识图谱。本季度首次发布“疾病临床表现”、“中毒”知识图谱及OMAHA知识库,并更新发布“药品适应证”知识图谱 。

 

 

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新发布图谱资源

 

“疾病临床表现”知识图谱

 

近年来,医学知识图谱很重要的应用方向之一就是医学领域的问答系统,例如医院的智能导诊机器人、线上挂号和线上问诊等系统。互联网诊疗中的问诊系统通过提取用户问题中的关键词,以医学知识图谱为支撑,形成答案返回给用户。它的本质就是通过在医学知识图谱中查询“疾病-临床表现”关系来完成患者的自查。新冠疫情的出现让越来越多人开始选择线上就诊。基于此需求,联盟启动了“疾病临床表现”知识图谱构建工作,希望可以助力问答等相关产品的开发。

 

“疾病临床表现”知识图谱共包含1.5万实体,8.0万三元组,其中0.6万实体与“七巧板”医学术语集建立映射 。“疾病临床表现”知识图谱关系模型见图1。

 

 

图1:“疾病临床表现”知识图谱关系模型

 

“中毒”知识图谱

 

据《中国统计年鉴(2020)》显示,中毒作为部分地区城市和农村居民前5位的死因一直受到大众的关注。以“中毒”知识图谱为支撑的医学人工智能系统,可以辅助医生鉴别诊断中毒患者,有效缩短诊断时间。尤其在急诊环境中,可以协助没有处理经验的医护人员快速开展救治工作,挽救更多的生命。基于此需求,联盟启动了“中毒”知识图谱构建工作。该图谱 包含0.5万实体,2.4万三元组,其中0.2万实体与“七巧板”医学术语集建立映射 。“中毒”知识图谱关系模型见图2。

 

 

图2:“中毒”知识图谱关系模型

 

OMAHA知识库

 

为了使服务机构能够更便捷地合并使用“汇知”医学知识图谱及“七巧板”医学术语集数据资源,联盟于2021年第一季度开始发布OMAHA知识库资源包,发布时间与“汇知”图谱保持一致,为每个季度第二个月20号,1年发布4次。 OMAHA知识库包含最新版“汇知”图谱及“七巧板”术语集数据,并遵循“汇知”图谱发布文件规范。本次OMAHA知识库共发布102万实体,587万三元组 。

 

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更新发布图谱资源

 

“药品适应症”知识图谱

 

为了更好地满足临床合理用药需求,联盟于2019年启动“药品适应证”知识图谱构建工作,并于同年9月首次发布“药品适应证”知识图谱。 本次更新发布的“药品适应证”知识图谱共包含3.7万实体, 43.0万三元组,其中2.4万实体与“七巧板”医学术语集映射 。更新内容如下:

 

新增《国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录(2020年)》中的医保支付类别和剂型关系;

 

新增收录国家和各省医保药品目录中的药品实体;

 

新增收录国家药品编码本位码(截至2020年12月31日)中的药品实体。

 

在根据国家和各省医保药品目录构建图谱时,发现有部分药品名称不严谨或不具有临床适用性,有少部分药品暂无查找到可靠来源的药品说明书。 基于这些问题,在构建图谱时采取了一定的解决措施,详细情况请见表1。

 

序号

问题类型

涉及数量

  解决措施
1 药品名称不严谨,例如《广西基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录(2020年版)》中的“感冒清颗粒”,正确名称应该为“感冒清热颗粒”。 24 已将相应的药品实体名称修正。
2 未找到可靠来源的药品说明书,例如《北京市基本医疗保险工伤保险和生育保险药品目录(2017年版)》中的“冠心丹参丸”。 33 继续跟进收集这些药品的说明书,收集后再进一步完善图谱。
3 药品名称不具有临床适用性,例如《国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录(2020年版)》中的“替加氟氯化钠”,临床常用药品名称是“替加氟氯化钠注射液”。 909 以临床常用药品名称为实体构建适应证关系。

 

表1: 基于国家和各省医保药品目录构建药品适应证关系时发现的问题及解决措施汇总

 

更多“汇知”医学知识图谱的信息您可以登陆HiTA服务平台(hita.omaha.org.cn)进行了解。

 

“汇知”医学知识图谱发展历程

 

2019年8月医学知识图谱Schema模型发布

 

2019年9月“药品-适应证”知识图谱发布

 

2020年5月“临床路径”知识图谱发布

 

2020年8月“疾病-科室”知识图谱、“心血管系统疾病”知识图谱发布

 

2020年11月“药品适应证”知识图谱更新及新型冠状病毒肺炎诊疗知识图谱发布

 

2021年2月 首次发布“疾病临床表现”、“中毒”知识图谱及OMAHA知识库

 

2021年5月即将发布更多知识图谱,敬请期待……

 

联系我们

 

HiTA服务:[email protected]

 

数字医学知识中心负责人徐美兰: [email protected]

 

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