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从零搭建Pytorch模型教程(一)数据读取

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前言

 

本文介绍了classdataset的几个要点,由哪些部分组成,每个部分需要完成哪些事情,如何进行数据增强,如何实现自己设计的数据增强。然后,介绍了分布式训练的数据加载方式,数据读取的整个流程,当面对超大数据集时,内存不足的改进思路。

 

本文延续了以往的写作态度和风格,即便是自己知道的内容,也仍然在写之前看了很多的文章来保证内容的正确性和全面性,因此写得极累,耗费时间较长。若有读者看完后觉得有所帮助,文末可以赞赏一点。

 

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(零) 概述

 

浮躁是人性的一个典型的弱点,很多人总擅长看别人分享的现成代码解读的文章,看起来学会了好多东西,实际上仍然不具备自己从零搭建一个pipeline的能力。

 

在公众号(CV技术指南)的交流群里( 群内交流氛围不错,有需要的请关注公众号加群 ),常有不少人问到一些问题,根据这些问题明显能看出是对pipeline不了解,却已经在搞项目或论文了,很难想象如果基本的pipeline都不懂,如何分析代码问题所在?如何分析结果不正常的可能原因?遇到问题如何改?

 

Pytorch在这几年逐渐成为了学术上的主流框架,其具有简单易懂的特点。网上有很多pytorch的教程,如果是一个已经懂的人去看这些教程,确实pipeline的要素都写到了,感觉这教程挺不错的。但实际上更多地像是写给自己看的一个笔记,记录了pipeline要写哪些东西,却没有介绍要怎幺写,为什幺这幺写,刚入门的小白看的时候容易云里雾里。

 

鉴于此,本教程尝试对于pytorch搭建一个完整pipeline写一个比较明确且易懂的说明。

 

本教程将介绍以下内容:

 

 

准备数据,自定义classdataset,分布式训练的数据加载方式,加载超大数据集的改进思路。

 

搭建模型与模型初始化。

 

编写训练过程,包括加载预训练模型、设置优化器、设置损失函数等。

 

可视化并保存训练过程。

 

编写推理函数。

 

 

(一)数据读取

 

classdataset的定义

 

先来看一个完整的classdataset

 

import torch.utils.data as data
import torchvision.transforms as transforms
class MyDataset(data.Dataset):
   def __init__(self,data_folder):
       self.data_folder = data_folder
       self.filenames = []
       self.labels = []
       per_classes = os.listdir(data_folder)
       for per_class in per_classes:
           per_class_paths = os.path.join(data_folder, per_class)
           label = torch.tensor(int(per_class))
           per_datas = os.listdir(per_class_paths)
           for per_data in per_datas:
               self.filenames.append(os.path.join(per_class_paths, per_data))
               self.labels.append(label)
   def __getitem__(self, index):
       image = Image.open(self.filenames[index])
       label = self.labels[index]
       data = self.proprecess(image)
       return data, label
   def __len__(self):
       return len(self.filenames)
   def proprecess(self,data):
       transform_train_list = [
           transforms.Resize((self.opt.h, self.opt.w), interpolation=3),
           transforms.Pad(self.opt.pad, padding_mode='edge'),
           transforms.RandomCrop((self.opt.h, self.opt.w)),
           transforms.RandomHorizontalFlip(),
           transforms.ToTensor(),
           transforms.Normalize([0.485, 0.456, 0.406], [0.229, 0.224, 0.225])
      ]
       return transforms.Compose(transform_train_list)

 

classdataset的几个要点:

 

 

classdataset类继承torch.utils.data.dataset。

 

classdataset的作用是将任意格式的数据,通过读取、预处理或数据增强后以tensor的形式输出。其中任意格式的数据可能是以文件夹名作为类别的形式、或以txt文件存储图片地址的形式、或视频、或十几帧图像作为一份样本的形式。而输出则指的是经过处理后的一个batch的tensor格式数据和对应标签。

 

classdataset主要有三个函数要完成:__init__函数、__getitem__ 函数和__len__函数。

 

 

__init__函数

 

init函数主要是完成两个静态变量的赋值。一个是用于存储所有数据路径的变量,变量的每个元素即为一份训练样本,(注:如果一份样本是十几帧图像,则变量每个元素存储的是这十几帧图像的路径),可以命名为self.filenames。一个是用于存储与数据路径变量一一对应的标签变量,可以命名为self.labels。

 

假如数据集的格式如下:

 

#这里的0,1指的是类别0,1
/data_path/0/image0.jpg
/data_path/0/image1.jpg
/data_path/0/image2.jpg
/data_path/0/image3.jpg
......
/data_path/1/image0.jpg
/data_path/1/image1.jpg
/data_path/1/image2.jpg
/data_path/1/image3.jpg

 

可通过per_classes = os.listdir(data_path) 获得所有类别的文件夹,在此处per_classes的每个元素即为对应的数据标签,通过for遍历per_classes即可获得每个类的标签,将其转换成int的tensor形式即可。在for下获得每个类下每张图片的路径,通过self.join获得每份样本的路径,通过append添加到self.filenames中。

 

__getitem__ 函数

 

getitem 函数主要是根据索引返回对应的数据。这个索引是在训练前通过dataloader切片获得的,这里先不管。它的参数默认是index,即每次传回在init函数中获得的所有样本中索引对应的数据和标签。因此,可通过下面两行代码找到对应的数据和标签。

 

image = Image.open(self.filenames[index]))
label = self.labels[index]

 

获得数据后,进行数据预处理。数据预处理主要通过 torchvision.transforms 来完成,这里面已经包含了常用的预处理、数据增强方式。其完整使用方式在官网有详细介绍:https://pytorch.org/vision/stable/transforms.html

 

上面这里介绍了最常用的几种,主要就是resize,随机裁剪,翻转,归一化等。

 

最后通过transforms.Compose(transform_train_list)来执行。

 

除了这些已经有的数据增强方式外,在《 数据增强方法总结 》中还介绍了十几种特殊的数据增强方式,像这种 自己设计了一种新的数据增强方式,该如何添加进去呢 ?

 

下面以随机擦除作为例子。

 

class RandomErasing(object):
   """ Randomly selects a rectangle region in an image and erases its pixels.
      'Random Erasing Data Augmentation' by Zhong et al.
      See https://arxiv.org/pdf/1708.04896.pdf
  Args:
        probability: The probability that the Random Erasing operation will be performed.
        sl: Minimum proportion of erased area against input image.
        sh: Maximum proportion of erased area against input image.
        r1: Minimum aspect ratio of erased area.
        mean: Erasing value.
  """
   def __init__(self, probability=0.5, sl=0.02, sh=0.4, r1=0.3, mean=[0.4914, 0.4822, 0.4465]):
       self.probability = probability
       self.mean = mean
       self.sl = sl
       self.sh = sh
       self.r1 = r1
   def __call__(self, img):
       if random.uniform(0, 1) > self.probability:
           return img
       for attempt in range(100):
           area = img.size()[1] * img.size()[2]
           target_area = random.uniform(self.sl, self.sh) * area
           aspect_ratio = random.uniform(self.r1, 1 / self.r1)
           h = int(round(math.sqrt(target_area * aspect_ratio)))
           w = int(round(math.sqrt(target_area / aspect_ratio)))
           if w < img.size()[2] and h < img.size()[1]:
               x1 = random.randint(0, img.size()[1] - h)
               y1 = random.randint(0, img.size()[2] - w)
               if img.size()[0] == 3:
                   img[0, x1:x1 + h, y1:y1 + w] = self.mean[0]
                   img[1, x1:x1 + h, y1:y1 + w] = self.mean[1]
                   img[2, x1:x1 + h, y1:y1 + w] = self.mean[2]
               else:
                   img[0, x1:x1 + h, y1:y1 + w] = self.mean[0]
               return img
       return img

 

如上所示,自己写一个类RandomErasing,继承object,在call函数里完成你的操作。在transform_train_list里添加上RandomErasing的定义即可。

 

transform_train_list = [
          transforms.Resize((self.opt.h, self.opt.w), interpolation=3),
          transforms.Pad(self.opt.pad, padding_mode='edge'),
          transforms.RandomCrop((self.opt.h, self.opt.w)),
          transforms.RandomHorizontalFlip(),
          transforms.ToTensor(),
          transforms.Normalize([0.485, 0.456, 0.406], [0.229, 0.224, 0.225])
          RandomErasing(probability=self.opt.erasing_p, mean=[0.0, 0.0, 0.0])
          #添加到这里
      ]

 

__len__函数

 

len函数主要就是返回数据长度,即样本的总数量。前面介绍了self.filenames的每个元素即为每份样本的路径,因此,self.filename的长度就是样本的数量。通过return len(self.filenames)即可返回数据长度。

 

验证classdataset

 

train_dataset = My_Dataset(data_folder=data_folder)
train_loader = DataLoader(train_dataset, batch_size=16, shuffle=False)
print('there are total %s batches for train' % (len(train_loader)))
for i,(data,label) in enumerate(train_loader):
    print(data.size(),label.size())

 

分布式训练的数据加载方式

 

前面介绍的是单卡的数据加载,实际上分布式也是这样,但为了高速高效读取,每张卡上也会保存所有数据的信息,即self.filenames和self.labels的信息。只是在DistributedSampler 中会给每张卡分配互不交叉的索引,然后由torch.utils.data.DataLoader来加载。

 

dataset = My_Dataset(data_folder=data_folder)
sampler = DistributedSampler(dataset) if is_distributed else None
loader = DataLoader(dataset, shuffle=(sampler is None), sampler=sampler)

 

数据读取的完整流程

 

结合上面这段代码,在这里,我们介绍以下读取数据的整个流程。

 

 

首先定义一个classdataset,在初始化函数里获得所有数据的信息。

 

classdataset中实现getitem函数,通过索引来获取对应的数据,然后对数据进行预处理和数据增强。

 

在模型训练前,初始化classdataset,通过Dataloader来加载数据,其加载方式是通过Dataloader中分配的索引,调用getitem函数来获取。

关于索引的分配,在单卡上,可通过设置shuffle=True来随机生成索引顺序;在多机多卡的分布式训练上,shuffle操作通过DistributedSampler来完成,因此shuffle与sampler只能有一个,另一个必须为None。

 

 

超大数据集的加载思路

 

问题所在

 

再回顾一下上面这个流程,前面提到所有数据信息在classdataset初始化部分都会保存在变量中,因此当面对超大数据集时,会出现内存不足的情况。

 

思路

 

将切片获取索引的步骤放到classdataset初始化的位置,此时每张卡都是保存不同的数据子集。通过这种方式,可以将内存用量减少到原来的world_size倍(world_size指卡的数量)。

 

参考代码

 

class RankDataset(Dataset):
   '''
  实际流程
  获取rank和world_size 信息 -> 获取dataset长度 -> 根据dataset长度产生随机indices ->
  给不同的rank 分配indices -> 根据这些indices产生metas
  '''
   def __init__(self, meta_file, world_size, rank, seed):
       super(RankDataset, self).__init__()
       random.seed(seed)
       np.random.seed(seed)
       self.world_size = world_size
       self.rank = rank
       self.metas = self.parse(meta_file)
   def parse(self, meta_file):
       dataset_size = self.get_dataset_size(meta_file)                                     # 获取metafile的行数
       local_rank_index = self.get_local_index(dataset_size, self.rank, self.world_size)   # 根据world size和rank,获取当前epoch,当前rank需要训练的index。
       self.metas = self.read_file(meta_file, local_rank_index)
   def __getitem__(self, idx):
       return self.metas[idx]
   def __len__(self):
       return len(self.metas)
   
##train
for epoch_num in range(epoch_num):
   dataset = RankDataset("/path/to/meta", world_size, rank, seed=epoch_num)
   sampler = RandomSampler(datset)
   dataloader = DataLoader(
               dataset=dataset,
               batch_size=32,
               shuffle=False,
               num_workers=4,
               sampler=sampler)

 

但这种思路比较明显的问题时,为了让每张卡上在每个epoch都加载不同的训练子集,因此需要在每个epoch重新build dataloader。

 

这一节参考链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/357809861

 

总结

 

本篇文章介绍了数据读取的完整流程,如何自定义classdataset,如何进行数据增强,自己设计的数据增强如何写,分布式训练是如何加载数据的,超大数据集的数据加载改进思路。

 

相信读完本文的读者对数据读取有了比较清晰的认识,下一篇将介绍搭建模型与模型初始化。

 

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