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本文给大家介绍数据分析中一个基础也是比较核心关键的环节——数据预处理,这是我们在做数据分析时候的最重要的前提,如果这步要是处理的很好的话,在后期的数据分析的环节中会很顺畅的,并且分析出来的结论也是很准确的。因此这个环节至关重要的。
数据预处理其实严格的说是在数据分析之前的一个环节,当我们从数据库或者其他途径获取到数据之后,接下来的环节不是马上对数据进行数据分析的。因为总有一些数据不是完整的或者不是我们业务所需要的,这写不需要的数据就是我们经常提到的“脏数据”。这个时候,我们就需要在做数据分析之前对数据进行相应的预处理,即把这些“脏数据”做一定的处理。首先我们介绍的是数据的无量钢化。
一、数据无量钢化
在机器学习算法的实践中,我们往往有着将不同规格的数据规格转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布的需求,这种需求就是我们经常提到的将数据进行“无量钢化”。正如梯度和矩阵为核心的算法中,对于逻辑回归(Logistic Regression,LR)、支持向量机(Support Vector Machine, SVM)、神经网络(Neural Networks, NN),无量钢化可以加快求解速度;而在距离类模型,比如K近邻,k-Means聚类中,无量钢化可以帮助我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成的影响。这里有一个使用无量钢化处理特别成熟的领域——在决策树和树的集成算法们,对决策树我们不需要无量钢化,决策树可以把任意数据处理的都很好的。
数据的无量钢化可以是线性的,也可以是非线性的。线性的无量钢化包括中心化(Zero-centered或者Mean-subtraction)处理和缩放处理(Scale)。其实中心化的本质就是让所有的记录减去一个固定好的值,即让数据样本数据平移到某个位置。缩放的本质是通过除以一个固定值,将数据固定在某个范围之中,取对数也算是一种缩放处理。
1、数据归一化
当数据(x)按照最小值中心化后,再按极差(最大值-最小值)缩放,数据就移动了最小值个单位,并且会被收敛到[0-1]之间,而这个过程我们就叫做数据归一化(Normalization,又称Min-Max Scaling)。这里需要我们注意的是: Normalization是归一化并不是正则化,其实真正的正则化是regularization。 不是数据预处理的一种手段。具体的数据归一化公式如下:
我们通过代码来事项数据的简单归一化,具体实现如下:
import numpy as np import pandas as pd data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]] x = np.array(data) print(x) # 实现numpy来实现归一化 x_nor = (x - x.min(axis=0)) / (x.max(axis=0) - x.min(axis=0)) print(x_nor) # 逆转归一化 x_returned = x_nor * (x.max(axis=0) - x.min(axis=0)) + x.min(axis= 0) print(x_returned) # 使用pandas来实现归一化 x_pandas = pd.DataFrame() # 使⽤pandas来实现归⼀化 x_normor = (x - x.min()) / (x.max() - x.min()) print(x_normor) #逆转归⼀化 x_adverse = x_normor * (x.max() - x.min()) + x.min() print(x_adverse)
具体的执行结果如下:
在sklearn工具中,我们使用 preprocessing.MinMaxScaler
来是现在这个功能。 MinMaxScaler
有一个重要的参数, feature_range
——控制我们希望把数据压缩到一定的范围,其中默认是[0,1]。具体实现如下:
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]] #实现归⼀化 scaler = MinMaxScaler() # 实例化 scaler = scaler.fit(data) #fit,在这⾥本质是⽣成min(x)和max(x) result = scaler.transform(data) #通过接⼝导出结果 print(result) result_ = scaler.fit_transform(data) #训练和导出结果⼀步达成 scaler.inverse_transform(result) #将归⼀化后的结果逆转 #使⽤MinMaxScaler的参数feature_range实现将数据归⼀化到[0,1]以外的范围中 scaler_1 = MinMaxScaler(feature_range=[5,10]) #依然实例化 result_1 = scaler.fit_transform(data) #fit_transform⼀步导出结果 print(result_1)
具体代码的执行结果如下:
2、数据标准化
当数据(x)按均值(μ)中心化后,再按标准差(δ)缩放,数据就变成满足均值为0,方差为1的分布,而这个过程就叫做数据标准化(Standardization,又称Z-score normalization),具体公式如下:
同样地,我们也可以通过 sklearn
中 preprocessing.StandardScaler模块
可以实现这一功能。具体实现如下:
from sklearn.preprocessing import StandardScaler data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]] scaler = StandardScaler() #实例化 print(scaler.fit(data)) #fit,本质是⽣成均值和⽅差 print(scaler.mean_) #查看均值的属性mean_ print(scaler.var_) #查看⽅差的属性var_ x_std = scaler.transform(data) #通过接⼝导出结果 print(x_std.mean()) #导出的结果是⼀个数组,⽤mean()查看均值 print(x_std.std()) #⽤std()查看⽅差 print(scaler.fit_transform(data)) # 使⽤fit_transform(data)⼀步达成结果 print(scaler.inverse_transform(x_std)) #使⽤inverse_transform逆转标准化
具体执行结果如下:
我们刚才介绍的是通过 sklearn
中 preprocessing.StandardScaler模块
实现了数据的归一化以及标准化。但是对于 StandardScaler
和 MinMaxScaler
来说, 空值NaN
会被当做是缺失值,在fit的时候忽略。在transform的时候保持缺失NaN的状态显示。并且,尽管去量纲化过程不是具体的算法,但在fit接口中,依然只允许导入至少二维数组,一维数组导入会报错。通常来说,我们输入的X会是我们的特征矩阵,但是在现实案例中特征矩阵不太可能是⼀维所以不会存在这个问题。
我们刚才在进行代码实现的时候,我们同时引用了sklearn中的 StandardScaler
和 MinMaxScaler
,那幺这两个我们一般在解决实际问题的时候应该如何选择呢?其实这需要看情况的,具体问题其实需要具体分析的。大多数机器学习算法中,会选择 StandardScaler
来进行特征缩放,因为 MinMaxScaler
对异常,值非常敏感。在PCA,聚类,逻辑回归,支持向量机,神经网络这些算法中,StandardScaler往往是最好的选择。MinMaxScaler在不涉及距离度量、梯度、协方差计算以及数据需要被压缩到特定区间时使用广泛,比如,数字图像处理中量化像素强度时,都会使用 MinMaxScaler
将数据压缩于[0,1]区间之中。这个时候建议先试试看StandardScaler,效果不好换MinMaxScaler。
除了 StandardScaler
和 MinMaxScaler
之外, sklearn
中也提供了各种其他缩放处理(中心化只需要一个pandas广播一下减去某个数就好了,因此 sklearn
不提供任何中心化功能)。比如,在希望压缩数据,却不影响数据的稀疏性时(不影响矩阵中取值为0的个数时),我们会使用 MaxAbsScaler
;在异常值多,噪声非常大时,我们可能会选择分位数来无量纲化,此时使用 RobustScaler
。
二、缺失值处理
机器学习和数据挖掘中所使用的数据,永远不可能是完美的。很多特征,对于分析和建模来说意义非凡,但对于实际收集数据的人却不是如此,因此数据挖掘之中,常常会有重要的字段缺失值很多,但是不能舍弃字段的情况。因此,数据预处理中非常重要的一项就是处理缺失值。
我们通过 pandas
来实现这一缺失值的处理,再实现之前,我们首先创建一个名为 Narrativedata.csv
的数据文件,具体内容如下:
为了方便大家练习, 大家也需要在自己电脑上创建这幺一个名字一样的文件,数据可以随便造,但是标题一定要一模一样,否则会报错的 。将创建好的文件放到我们代码同一级目录,本人放置的位置如下:
都准备好数据和文件的前提下,我们接着去实现相应的代码,具体实现如下:
import pandas as pd data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") print(data.head())
具体执行的结果如下:
在这里,我们需要解释一下数据的来源,该数据是从一个特别经典的《泰坦尼克号》提取出来的数据,这个数据有三个特征,一个数值型,两个字符型,标签也是字符型。(数据说明:Embarked指乘客登船港⼝,S是英国的Southampton,C是法国的Cherbourg,Q是爱尔兰的Queens town)从这里开始,我们就使用这个数据给大家作为例子,让大家慢慢熟悉sklearn中数据预处理的各种方式。
首先就是 impute.SimpleImputer
,具体源码是这样的:
class sklearn.impute.SimpleImputer (missing_values=nan, strategy=’mean’, fill_value=None, verbose=0, copy=True)
这个类是专门用来填补缺失值的。它包括四个重要参数,具体详情如下:
我们通过代码具体实现如何使用这些方法的,具体实现如下:
import pandas as pd from sklearn.impute import SimpleImputer data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") print(data.info()) #查看缺失值 print(data.isnull().sum()) #填补年龄 Age = data.loc[:,"Age"].values.reshape(-1,1) #sklearn当中特征矩阵必须是⼆维 print(Age[:20]) imp_mean = SimpleImputer() #实例化,默认均值填补 imp_median = SimpleImputer(strategy="median") #⽤中位数填补 imp_0 = SimpleImputer(strategy="constant",fill_value=0) #⽤0填补 #fit_transform⼀步完成调取结果 imp_mean = imp_mean.fit_transform(Age) imp_median = imp_median.fit_transform(Age) imp_0 = imp_0.fit_transform(Age) print(imp_mean[:20]) print(imp_median[:20]) print(imp_0[:20]) #在这⾥我们使⽤中位数填补Age data.loc[:,"Age"] = imp_median print(data.info()) #使⽤众数填补Embarked Embarked = data.loc[:,"Embarked"].values.reshape(-1,1) imp_mode = SimpleImputer(strategy = "most_frequent") data.loc[:,"Embarked"] = imp_mode.fit_transform(Embarked) print(data.info())
具体执行的结果如下:
我们再通过Pandas和Numpy来进行实现这个功能,具体实现如下:
import pandas as pd data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") print(data.head()) data.loc[:,"Age"] = data.loc[:,"Age"].fillna(data.loc[:,"Age"].median()) #.fillna 在DataFrame⾥⾯直接进⾏填补 print(data.dropna(axis=0,inplace=True))
具体执行的结果如下:
三、处理分类型特征:编码与哑变量
在机器学习中,大多数算法,比如k近邻算法,逻辑回归,支持向量机SVM等都只能够处理数值型数据,不能处理文字,在sklearn当中,除了专用来处理文字的算法,其他算法在fit的时候全部要求输⼊数组或矩阵,也不能够导导入字型数据(其实手写决策树和朴素贝叶斯可以处理文字,但是sklearn中规定必须导入数值型)。
然而在现实中,许多标签和特征在数据收集完毕的时候,都不是以数字来表现的。比如说,学历的取值可以是[“小学”,“初中”,“高中”,”大学”],付费方式可能包含[“支付宝”,“现金”,“微信”]等等。在这种情况下,为了让数据适应算法和库,我们必须将数据进行编码,即是说,将文字型数据转换为数值型。
在 skleran
中, preprocessing.LabelEncoder
是标签专用,能够将分类转换为分类数值。具体实现如下:
import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") y = data.iloc[:,-1] #要输⼊的是标签,不是特征矩阵,所以允许⼀维 le = LabelEncoder() #实例化 le = le.fit(y) #导⼊数据 label = le.transform(y) #transform接⼝调取结果 data.iloc[:,-1] = label #让标签等于我们运⾏出来的结果 print(data.head()) #查看相关属性 print(le.classes_) #属性.classes_查看标签中究竟有多少类别 print(label) #查看获取的结果label print(le.fit_transform(y)) #也可以直接fit_transform⼀步到位 print(le.inverse_transform(label)) #使⽤inverse_transform可以逆转 #如果不需要教学展示的话我们一般会这幺写: data.iloc[:,-1] = LabelEncoder().fit_transform(data.iloc[:,-1])
具体的实现如下:
另外还有一个方法 preprocessing.OrdinalEncoder
特征专用,能够将分类特征转换为分类数值。具体实现代码如下:
import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from sklearn.preprocessing import OrdinalEncoder data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") data_ = data.copy() data_.iloc[:,1:-1] = OrdinalEncoder().fit_transform(data_.iloc[:,1:-1]) #接⼝categories_对应LabelEncoder的接⼝classes_,⼀模⼀样的功能 OrdinalEncoder().fit(data_.iloc[:,1:-1]).categories_ data_.head()
程序会报有空值的情况,具体执行结果如下:
方法 preprocessing.OrdinalEncoder
特征专用,能够将分类特征转换为分类数值。而 preprocessing.OneHotEncoder
独热编码,创建哑变量。
我们刚才已经用 OrdinalEncoder
把分类变量 Sex
和 Embarked
都转换成数字对应的类别了。在登船港口 Embarked
这一列中,我们使用[0,1,2]代表了三个不同的舱门,然而这种转换是正确的吗?然而我们在思考三种不同性质的分类数据:
登船港口(S,C,Q),三种取值S,C,Q是相互独立的,彼此之间完全没有联系,表达的是S≠C≠Q的概念。这是名义变量。
学历(小学,初中,高中),三种取值不是完全独立的,我们可以明显看出,在性质上可以有高中>初中>小学这样的联系,学历有高低,但是学历取值之间却不是可以计算的,我们不能说小学 + 某个取值 = 初中。这是有序变量。
体重(>45kg,>90kg,>135kg),各个取值之间有联系,且是可以互相计算的,比如120kg – 45kg = 90kg,分类之间可以通过数学计算互相转换。这是有距变量。
然而在对特征进⾏编码的时候,这三种分类数据都会被我们转换为[0,1,2],这三个数字在算法看来,是连续且可以计算的,这三个数字互不相等,有大小,并且有着可以相加相乘的联系。所以算法会把舱门,学历这样的分类特征,都误会成是体重这样的分类特征。这是说,我们把分类转换成数字的时候,忽略了数字中⾃带的数学性质,所以给算法传达了一些不准确的信息,而这会影响我们的建模。
类别 OrdinalEncoder
可以用来处理有序变量,但对于名义变量,我们只有使用哑变量的方式来处理,才能够尽量向算法传达最准确的信息,具体转换如下:
这样的变化,让算法能够彻底领悟,原来三个取值是没有可计算性质的,是“有你就没有我”的不等概念。在我们的数据中,性别和登船港口,都是这样的名义变量。因此我们需要使用独热编码,将两个特征都转换为哑变量。具体实现如下:
import pandas as pd from sklearn.preprocessing import OrdinalEncoder from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") X = data.iloc[:,1:-1] #提取出所有的名义变量 result = OneHotEncoder(categories='auto').fit_transform(X).toarray() #进⾏独热编码 newdata = pd.concat([data,pd.DataFrame(result)],axis=1) #合并原数据和编码后的结果 newdata.drop(["Sex","Embarked"],axis=1,inplace=True) #删除原名义变量 newdata.columns =["Age","Survived","Female","Male","Embarked_C","Embarked_Q","Embarked_S"] #重命名列名 print(newdata) #实例化并训练模型 enc = OneHotEncoder(categories='auto').fit(X) #transform接⼝调取结果 re = enc.transform(X).toarray() print(re) print(re.shape) #依然可以还原 print(pd.DataFrame(enc.inverse_transform(re))) #获取模型特证名 print(enc.get_feature_names()) #合并原数据和独热编码 df = pd.concat([data,pd.DataFrame(re)],axis=1) #axis=1,表示跨⾏进⾏合并,也就是将量表左右相连,如果是axis=0,就是将量表上下相连 print(df.head()) #删除做过独热编码的特征 print(df.drop(['Embarked','Sex'],axis=1,inplace=True)) print(df.head()) #修改列名 df.columns = ['Age','Survived','Female', 'Male', 'Embarked_C', 'Embarked_Q', 'Embarked_S'] print(df.head())
特征可以做哑变量,标签也可以吗?可以,使用类 sklearn.preprocessing.LabelBinarizer
可以对标签做哑变量,许多算法都可以处理多标签问题(比如说决策树),但是这样的做法在现实中不常用,因此我们在这里就不赘述了。以下是编码与哑编码的相关介绍:
当然数据类型以数据类型以及常用的统计量,具体如下:
四、处理连续型特征:二值化与分段
根据阈值将数据二值化(将特征值设置为0或1),用于处理连续型变量。大于阈值的值映射为1,而小于或等于阈值的值映射为0。默认阈值为0时,特征中所有的正值都映射到1。二值化是对文本计数数据的常用操作,分析人员可以决定仅考虑某种现象的存在与否。它还可以用作考虑布尔随机变量的估计器的预处理步骤(例如,使用贝叶斯设置中的伯努利分布建模)。
import pandas as pd from sklearn.preprocessing import Binarizer data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") data_2 = data.copy() print(data_2) X = data_2.iloc[:,0].values.reshape(-1,1) #类为特征专⽤,所以不能使⽤⼀维数组 transformer = Binarizer(threshold=30).fit_transform(X) print(transformer)
preprocessing.KBinsDiscretizer
是将连续型变量划分为分类变量的类,能够将连续型变量排序后按顺序分箱后编码。总共包含三个重要参数,主要含义如下:
具体用法如下:
import pandas as pd from sklearn.preprocessing import KBinsDiscretizer data = pd.read_csv("Narrativedata.csv") X = data.iloc[:,0].values.reshape(-1,1) est = KBinsDiscretizer(n_bins=3, encode='ordinal', strategy='uniform') print(est.fit_transform(X)) #查看转换后分的箱:变成了⼀列中的三箱 print(set(est.fit_transform(X).ravel())) est = KBinsDiscretizer(n_bins=3, encode='onehot', strategy='uniform') #查看转换后分的箱:变成了哑变量 print(est.fit_transform(X).toarray()) est = KBinsDiscretizer(n_bins=3, encode='onehot', strategy='quantile') #查看转换后分的箱:变成了哑变量,且每个类别数量基本相等 print(est.fit_transform(X).toarray().sum(0))
总结
本文主要给大家介绍了数据分析中最为重要的一步——数据预处理。主要包括数据无量钢化,其中有数据归一化以及数据的标准化。接着又介绍了数据中缺失值的处理以及处理分类型的特征——编码与哑编码、二值化与分段,文中各大方法都通过Python案例加以实现。希望大家认真掌握。
参考文献
[1]. 数据无量钢化
[2]. 数据归一化
[3]. 编码与哑编码
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